单细胞交响乐
单细胞交响乐
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前言：我与《单细胞交响乐》的缘分
1 准备篇：背景知识
2 积累篇：文献阅读
3 流程篇：分析框架
3.1 质控
3.2 归一化
3.3 挑选表达量高变化基因
3.4 降维
3.5 聚类
3.6 Marker/标记基因检测
3.7 细胞类型注释
3.8 批次效应处理
3.9 多样本间差异分析
3.10 检测Doublet
3.11 细胞周期推断
3.12 细胞轨迹推断
3.13 与蛋白丰度信息结合
3.14 处理大型数据
3.15 不同R包数据的相互转换
4 实战篇：活学活用
5 补充篇：开拓思路
3 流程篇：分析框架
基本的单细胞转录组分析都包括哪些内容呢？理解了这些内容，才能明白各个R包的共同点
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