单细胞交响乐
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前言：我与《单细胞交响乐》的缘分
1 准备篇：背景知识
2 积累篇：文献阅读
2.1.1 综述 | 2019-单细胞转录组分析最佳思路
2.1.2 综述 | 2018-单细胞捕获平台
2.1.3 综述 | 2017-scRNA中的细胞聚类分群
2.1.4 综述 | scRNA已经开发出超过1000款工具了，你用过几种？
2.1.5 综述 | 2021-单细胞测序的微流控技术应用
2.2.1 研究 | 2018-单细胞转录组探索 癌症免疫治疗获得性抗性机理
2.2.2 研究 | 2018-人类结直肠癌单细胞多组学分析
2.2.3 研究 | 2020-单细胞分析揭示葡萄膜黑色素瘤新的进化复杂性
2.2.4 研究 | 2020-COVID-19病人支气管免疫细胞单细胞测序分析
2.2.5 研究 | 2020-原汁原味读--单细胞肿瘤免疫图谱
2.2.6 研究 | 2021-多发性骨髓瘤发展过程中肿瘤和免疫细胞的共同进化
2.2.7 研究 | 2021-多个组织的成纤维细胞图谱
2.2.8 研究 | 2021-多组学分析肺结核队列的记忆T细胞状态
2.2.9 研究 | 2021-CancerSCEM: 人类癌症单细胞表达图谱数据库
2.2.10 研究| 2021-单细胞转录组分析COVID-19重症患者肺泡巨噬细胞亚型
2.2.11 研究 |2021-单细胞转录组揭示肺腺癌特有的肿瘤微环境
2.2.12 研究 | 2021-单细胞转录组揭示乳头状甲状腺癌起始与发展
2.2.13 研究 | 2021-解析食管鳞癌化疗病人的单细胞转录组
2.2.14 研究 | 2021-单细胞水平看骨髓瘤的细胞状态和基因调控
2.3.1 算法｜2020-BatchBench比较scRNA批次矫正方法
2.3.2 算法 | 2021-scPhere——用地球仪来展示降维结果
2.3.3 算法 | 2021-单细胞差异分析方法评测
2.3.4 算法 | 2021-细胞分群新方法——CNA（co-varying neighborhood analysis）
2.3.5 工具 | 2018-iSEE：单细胞数据可视化辅助网页工具
2.3.6 工具 | 2021-MACA: 一款自动注释细胞类型的工具
2.3.7 工具 | 2021-一个很有想法的工具——Ikarus，想要在单细胞水平直接鉴定肿瘤细胞
3 流程篇：分析框架
4 实战篇：活学活用
5 补充篇：开拓思路
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2 积累篇：文献阅读
单细胞发展日新月异，每年都会有大量 的优质文章发表，建议先阅读几篇综述类，掌握核心分析点；然后再看看解决了什么问题，又是怎么解决的
优质的文献资源链接：
为了方便使用，我把表格传到了腾讯文档
The single-cell studies database has reached 1000 studies
scEpigenetics
组织架构
主要将文献分为了：综述（2.1开头）、研究（2.2开头）、算法（2.3开头）
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1.2 总览 | 从实验到分析
下一个
2.1.1 综述 | 2019-单细胞转录组分析最佳思路
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2yr ago
